Природа заповедника
Флора заповедной территории насчитывает 905 видов высших сосудистых растений, 89 видов мохообразных, 232 вида водорослей, 21 вид миксомицетов, 257 видов грибов, 383 вида лишайников. Растительность заповедника изменяется в зависимости от высоты местности над уровнем моря. Можно выделить низкогорный (до 900 м над ур. м.), среднегорный (от 900 до 1400 м над ур. м.) и высокогорный (1400 м над ур. м. и выше) растительные пояса.
Основной растительный покров Тигирецкого хребта составляют леса черневой тайги, в которых произрастают растения доледникового периода – третичные реликты: осмориза остистая (Osmorhiza aristata (Thunb.) Rydb.), копытень европейский (Asarum europaeum L.), волчеягодник обыкновенный (Daphne mesereum L.), колокольчик широколистный (Campanula latifolia L.), многорядник Брауна (Polystichum braunii (Spenn.) Fee), подлесник уральский (Sanicula uralensis (Kleop. ex R. Kam) Chubarov et Shmakov). На большей части территории заповедника преобладают осиново-пихтовые леса, в долинах рек произрастают чистые пихтачи, кедрово-пихтовые леса занимают горно-таежный подпояс, а верхнюю границу леса образуют кедрово-пихтовые редколесья с участками субальпийских высокотравных лугов. В черневой тайге большой интерес представляют лишайники: в условиях высокой влажности воздуха они почти полностью покрывают стволы деревьев до высоты 7–12 м, зелеными «бородами» свешиваясь с ветвей. В высокогорном альпийско-тундровом поясе развиты альпийские луга. На высотах 500–900 м над ур. м. значительные площади занимают подпояс луговых степей и подпояс кустарников.
На территории заповедника встречается 35 редких и исчезающих видов сосудистых растений, 12 видов лишайников и 2 вида грибов, включенных в национальную и региональную красные книги.
Фауна заповедника включает 65 вида зверей, 198 видов птиц, 6 видов пресмыкающихся, 2 вида амфибий, 13 видов костных рыб и более 2100 видов беспозвоночных. Следует отметить, что изучение фауны беспозвоночных животных далеко не завершено и число их видов может существенно увеличится.
Широко распространены горностай, ласка, лисица. Обычен бурый медведь. Более редки волк, рысь, барсук, соболь, росомаха. Из парнокопытных обычна сибирская косуля, марал, кабан, лось. Из птиц обитают: тетерев, малый дятел, лесной конёк, полевой лунь, чёрная куропатка. Очень редок чёрный аист, белоголовый сип (включены в Красные книги Российской Федерации и Алтайского края). Редки полевой лунь, тетеревятник, перепелятник, беркут, чёрный гриф, обыкновенная пустельга. Амфибии представлены остромордой лягушкой и серой жабой. Последняя встречается до высоты 1500 м, что для Алтая необычно. Из рептилий отмечены обыкновенная гадюка, обыкновенный уж, узорчатый полоз, Палласов щитомордник, живородящая и прыткая ящерицы.
Гидросистема территории лишена озер и представлена исключительно горными реками с быстрым течением, в которых встречаются таймень, хариус, щука, елец, речной гольян, сибирский пескарь, налим, окунь, сибирский голец. Таймень на Алтае чрезвычайно редок: он включён в региональные Красные книги Алтайского края и Республики Алтай. На территории заповедника встречается 44 редких и исчезающих вида животных; в том числе 15 видов зверей, 28 видов птиц, 1 вид рыб, 11 видов насекомых, включённых в национальную и региональную Красные книги.